Is de kleine Flamingo gevaar?

Ondanks dat het de meest talrijke flamingosoort is, wordt het geclassificeerd als bijna bedreigd vanwege de afnemende populatie en het lage aantal broedplaatsen, waarvan sommige worden bedreigd door menselijke activiteiten. De bevolking in de twee belangrijkste Oost-Afrikaanse meren, Nakuru en Bogoria, is de afgelopen jaren negatief beïnvloed door een vermoedelijke vergiftiging door zware metalen, terwijl het primaire Afrikaanse broedgebied in Lake Natron momenteel wordt bedreigd door een voorgestelde natriumcarbonaatfabriek van Tata Chemicals. De enige broedplaats in Zuid-Afrika, gelegen aan de Kamfers Dam, wordt bedreigd door vervuiling en oprukkende ontwikkeling. De kleine flamingo is een van de soorten waarop de Overeenkomst inzake de instandhouding van Afrikaans-Euraziatische trekkende watervogels van toepassing is.